探索蛋白質組學新境界——第一屆AI蛋白質組學技術研討會召開
2023年11月17日,上海易算生物科技有限公司與復旦大學生物醫(yī)學研究院聯(lián)合舉辦第一屆AI蛋白質組學技術研討會-暨易算生物第一代易肽蛋白質組學質譜前處理機器人發(fā)布研討會。研討會邀請了多位業(yè)內專家、學者,分享臨床蛋白質組學大隊列研究最新進展。易算生物同時為參會專家老師介紹第一代易肽蛋白質組學質譜前處理機器人-易肽AUTO100蛋白質組學全自動前處理工作站,吸引了近百位行業(yè)專家參與研討會,共同探討交流蛋白質組學技術的發(fā)展。
會議現(xiàn)場
復旦大學教授、博士生導師 陸豪杰致辭
易算生物CEO、復旦大學博士 沈誠頻致辭
現(xiàn)場參觀復旦大學生物醫(yī)學研究院蛋白質組學中心
該中心引進了易肽AUTO100蛋白質組學全自動前處理工作站,并一直使用其進行臨床大隊列樣本的蛋白組前處理工作,成效顯著。會議期間易算生物工程師為參會專家細致講解了易肽AUTO100,其將推動質譜前處理通量、速度、重復性飛躍。
報告人:復旦大學教授、博士生導師 陸豪杰
報告題目:糖蛋白質組學中大隊列樣品數(shù)據(jù)重復性的思考
糖鏈是繼蛋白質、核酸之后的第三條生命之鏈,未來生命科學的重大發(fā)現(xiàn)將更多地依賴于對糖鏈的研究。報告介紹了用于臨床糖蛋白質組學的高通量樣品前處理平臺、高通量完整糖肽定量策略(HTiGQs)揭示肝臟疾病中的糖基化特征、基于靶向質譜的高通量完整糖肽定量策略(HTiGQs-Target)用于驗證肝臟疾病中的糖基化特征、基于離子淌度質譜的完整糖肽唾液酸連接異構體的相對定量新方法。
報告人:華東師范大學教授、博士生導師 萬晶晶
報告題目:空間多組學的新方法和應用
空間組學被認為是生命科學的新前沿。空間組學通過同時測量組織結構和分子特征來為生物學研究開辟新的篇章,幫助人們重新解釋生命系統(tǒng)的的復雜性,并帶來生理學和病理學領域的變革。報告介紹了單細胞代謝組學新技術及應用、單細胞蛋白質組學新技術及應用、空間多組學定位和取樣技術介紹。報告還介紹了空間多組學研究難點及展望:單細胞數(shù)據(jù)分析深度和通量的進一步提升;單細胞數(shù)據(jù)的定量準確性考量;數(shù)據(jù)采集的質控、標準化和歸一化;超大量數(shù)據(jù) (Ntb) 的分析及有效信息的提取;圖像的拼接與對準,尤其是3D圖像;分子數(shù)據(jù)與圖像數(shù)據(jù)的整合和可視化等。
報告人:上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院研究員、博士 印彤
報告題目:血漿/血清蛋白組在轉化醫(yī)學研究中的應用
血漿/血清蛋白組學研究將有助于醫(yī)生提出精準治療方案,可輔助疾病的診斷、分子分型治療監(jiān)測、預后評估等。報告介紹了血漿/血清蛋白組學的研究技術和方案(質譜、Olink和SomaScan),血漿/血清蛋白組在轉化醫(yī)學研究中的案例,和國家轉化醫(yī)學中心(上海)的平臺和設備介紹。最后介紹了該平臺的科研產(chǎn)出:新冠感染者和接種患者、胰腺導管腺癌和急性髓細胞白血病相關生物樣本的蛋白組研究,血栓樣本的深度血液蛋白組研究。
報告人:上海拜譜生物科技有限公司技術總監(jiān) 戴捷
報告題目:高通量質譜多組學技術的發(fā)展與應用
過去大隊列質譜組學存在機時、批次效應、數(shù)據(jù)平行性、數(shù)據(jù)重復性、數(shù)據(jù)可靠性等難點與痛點,對質譜技術提出了更高通量、更微量樣品和更深的覆蓋度等要求。報告介紹了拜譜全系列蛋白質組學產(chǎn)品升級——Astral在常規(guī)蛋白組、大隊列蛋白組、修飾蛋白組、微量蛋白組和單細胞蛋白組方面的應用。
報告人:Bruker生命科學質譜中國區(qū)應用經(jīng)理 劉先明
報告題目:用高靈敏度4D-多組學質譜改變生命科學研究方式
隨著新型質譜技術的出現(xiàn),蛋白質組學在近年來發(fā)展迅速,蛋白質組學研究從關注“量”發(fā)展到關注“質”的新時代。報告介紹了基于布魯克timsTOF Ultra質譜的4D-單細胞蛋白質組學技術,整套流程已經(jīng)成熟可復制,同時還介紹了基于timsTOF HT結合MALDI質譜成像的空間蛋白質組學技術,該流程在空間代謝組、空間脂質組、空間蛋白組和空間糖組學研究中均已應用成熟。
報告人:易算生物CEO、復旦大學博士 沈誠頻
報告題目:自動化推動質譜前處理通量、速度、重復性飛躍
易算生物成立于2016年,公司核心業(yè)務是以DIA技術為核心,開展圍繞大隊列、自動化、高靈敏的蛋白質組學檢測技術。針對不同蛋白質組質譜平臺需求,定制全套分析流程和產(chǎn)品。報告介紹了易肽AUTO100蛋白質組學全自動前處理工作站的工作流程、日程維護和實際應用等。易肽AUTO100可以實現(xiàn)從蛋白到多肽的全自動化操作,靈活設置1-96個樣本,96個樣本處理用時僅需3h;全圖形化流程設定,1小時即可上手;兼容極微量蛋白前處理、低豐度蛋白富集、FFPE樣本蛋白前處理、修飾肽段富集、TMT標記等實驗流程。易肽AUTO100為無人值守、自動化、高通量的蛋白質組學研究鋪平道路。
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